| 1. Round | 03/02/2025 | Leones FC | - | Boca Juniors de Cali | 1:1 | ||||
| 2. Round | 10/02/2025 | Boca Juniors de Cali | - | Deportes Quindío | 4:0 | ||||
| 3. Round | 16/02/2025 | Internacional de Palmira | - | Boca Juniors de Cali | 1:0 |  |
|||
| 4. Round | 21/02/2025 | Boca Juniors de Cali | - | Patriotas FC | 1:2 | ||||
| 5. Round | 02/03/2025 | Real Cartagena | - | Boca Juniors de Cali | 3:2 | ||||
| 6. Round | 07/03/2025 | Boca Juniors de Cali | - | Cúcuta Deportivo | 0:2 | ||||
| 7. Round | 17/03/2025 | Real Soacha Cundinamarca | - | Boca Juniors de Cali | 1:0 | ||||
| 10. Round | 06/04/2025 | Boca Juniors de Cali | - | Atlético Huila | 1:2 | ||||
| 12. Round | 23/04/2025 | Boca Juniors de Cali | - | Orsomarso SC | 0:1 | ||||
| 13. Round | 27/04/2025 | Bogotá FC | - | Boca Juniors de Cali | 1:0 | ||||
| 14. Round | 05/05/2025 | Boca Juniors de Cali | - | Atlético FC | 2:1 |
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