| 1. Round | 29/07/2012 | Standard Liège | - | SV Zulte Waregem | 0:1 |  |
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| 2. Round | 05/08/2012 | SV Zulte Waregem | - | KAA Gent | 3:1 | ||||
| 5. Round | 26/08/2012 | KRC Genk | - | SV Zulte Waregem | 2:0 | ||||
| 6. Round | 01/09/2012 | SV Zulte Waregem | - | RAEC Mons | 2:4 |  |
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| 7. Round | 15/09/2012 | Oud-Heverlee Leuven | - | SV Zulte Waregem | 0:1 | ||||
| 8. Round | 22/09/2012 | SV Zulte Waregem | - | RSC Anderlecht | 2:3 | ||||
| 9. Round | 29/09/2012 | Lierse SK (old) | - | SV Zulte Waregem | 1:4 | ||||
| 10. Round | 06/10/2012 | SV Zulte Waregem | - | Cercle Brugge | 3:1 | ||||
| 17. Round | 24/11/2012 | KAA Gent | - | SV Zulte Waregem | 0:1 | |
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| 19. Round | 08/12/2012 | KV Kortrijk | - | SV Zulte Waregem | 1:2 |
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