| 2. Round | 27/08/2016 | RB Linense | - | Atlético Sanluqueño CF | 3:1 | ||||
| 3. Round | 04/09/2016 | Extremadura UD | - | RB Linense | 1:0 | ||||
| 4. Round | 11/09/2016 | RB Linense | - | CF Villanovense | 0:2 | ||||
| 6. Round | 25/09/2016 | RB Linense | - | Real Murcia | 3:1 |  |
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| 7. Round | 01/10/2016 | RB Linense | - | Recreativo Huelva | 0:0 | ||||
| 13. Round | 06/11/2016 | RB Linense | - | Mérida AD | 2:5 | ||||
| 14. Round | 13/11/2016 | Lorca FC | - | RB Linense | 3:2 | ||||
| 16. Round | 27/11/2016 | Granada CF B | - | RB Linense | 3:0 | ||||
| 17. Round | 04/12/2016 | RB Linense | - | San Fernando CD | 0:2 | ||||
| 18. Round | 11/12/2016 | FC Cartagena | - | RB Linense | 1:1 | ||||
| 19. Round | 18/12/2016 | RB Linense | - | Marbella FC | 0:2 |
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