| 2. Round | 09/07/2016 | Millonarios | - | Santa Fe | 1:0 |  |
|||
| 3. Round | 14/07/2016 | Santa Fe | - | Atlético Bucaramanga | 1:0 | ||||
| 5. Round | 25/07/2016 | Santa Fe | - | Envigado FC | 2:0 |  |
|||
| 9. Round | 21/08/2016 | Santa Fe | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 10. Round | 29/08/2016 | Santa Fe | - | Millonarios | 1:2 | |
|||
| 7. Round | 03/09/2016 | Santa Fe | - | La Equidad | 1:1 | |
|||
| 11. Round | 12/09/2016 | Patriotas FC | - | Santa Fe | 2:0 | ||||
| 12. Round | 16/09/2016 | Santa Fe | - | Deportivo Cali | 2:2 | |
|||
| 13. Round | 19/09/2016 | Deportivo Pasto | - | Santa Fe | 0:1 | ||||
| 16. Round | 16/10/2016 | Águilas Doradas | - | Santa Fe | 0:4 | |
|||
| 18. Round | 29/10/2016 | Fortaleza FC | - | Santa Fe | 1:1 | ||||
| 19. Round | 07/11/2016 | Santa Fe | - | Atlético Nacional | 0:0 |
Colombia