| 1. Round | 05/01/2013 | Monarcas Morelia | - | Cruz Azul | 3:3 |  |
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| 2. Round | 12/01/2013 | Cruz Azul | - | Club San Luis | 2:1 | ||||
| 3. Round | 20/01/2013 | Deportivo Guadalajara | - | Cruz Azul | 1:1 | |
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| 5. Round | 03/02/2013 | Club León | - | Cruz Azul | 2:2 | ||||
| 6. Round | 09/02/2013 | Cruz Azul | - | Pumas UNAM | 1:1 | ||||
| 7. Round | 17/02/2013 | CF Pachuca | - | Cruz Azul | 2:1 | ||||
| 8. Round | 23/02/2013 | Cruz Azul | - | UANL Tigres | 1:2 | ||||
| 9. Round | 02/03/2013 | CF América | - | Cruz Azul | 3:0 | ||||
| 10. Round | 09/03/2013 | Cruz Azul | - | Jaguares Chiapas | 1:1 | ||||
| 12. Round | 30/03/2013 | Cruz Azul | - | Atlas Guadalajara | 1:2 | ||||
| 13. Round | 07/04/2013 | Gallos Blancos (old) | - | Cruz Azul | 1:2 | |
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| 14. Round | 13/04/2013 | Cruz Azul | - | Club Tijuana | 5:0 | |
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| 15. Round | 21/04/2013 | Deportivo Toluca | - | Cruz Azul | 0:2 | ||||
| 16. Round | 27/04/2013 | Cruz Azul | - | Santos Laguna | 1:0 | ||||
| 17. Round | 05/05/2013 | CF Monterrey | - | Cruz Azul | 1:5 |
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