| 3. Round | 15/08/2003 | Cruz Azul | - | Atlas Guadalajara | 4:1 | ||||
| 4. Round | 22/08/2003 | Real San Luis | - | Cruz Azul | 0:0 | ||||
| 5. Round | 29/08/2003 | Cruz Azul | - | Santos Laguna | 0:2 |  |
|||
| 6. Round | 15/09/2003 | Atlante | - | Cruz Azul | 3:3 | ||||
| 8. Round | 20/09/2003 | CF Pachuca | - | Cruz Azul | 4:1 | ||||
| 9. Round | 23/09/2003 | Cruz Azul | - | Monarcas Morelia | 0:2 | ||||
| 11. Round | 03/10/2003 | Cruz Azul | - | UANL Tigres | 1:1 | ||||
| 12. Round | 11/10/2003 | Deportivo Toluca | - | Cruz Azul | 1:2 |  |
|||
| 14. Round | 21/10/2003 | Club Necaxa | - | Cruz Azul | 0:0 | ||||
| 15. Round | 24/10/2003 | Cruz Azul | - | Puebla FC | 1:0 | |
|||
| 16. Round | 01/11/2003 | Pumas UNAM | - | Cruz Azul | 2:1 | ||||
| 17. Round | 08/11/2003 | Club Irapuato | - | Cruz Azul | 1:2 | ||||
| 18. Round | 14/11/2003 | Cruz Azul | - | Veracruz (old) | 2:3 | ||||
| 19. Round | 21/11/2003 | UAG Tecos | - | Cruz Azul | 2:5 |
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