| 6. Round | 22/09/2012 | KSK Heist | - | KVC Westerlo | 0:1 | ||||
| 7. Round | 29/09/2012 | KVC Westerlo | - | Royal Mouscron-Péruwelz | 2:1 |  |
|||
| 8. Round | 06/10/2012 | CS Visé | - | KVC Westerlo | 1:2 | ||||
| 10. Round | 21/10/2012 | RBD Borinage | - | KVC Westerlo | 0:1 | ||||
| 11. Round | 27/10/2012 | KVC Westerlo | - | AFC Tubize | 2:2 | ||||
| 12. Round | 02/11/2012 | KAS Eupen | - | KVC Westerlo | 3:0 | ||||
| 13. Round | 09/11/2012 | KVC Westerlo | - | Royal Antwerp FC | 0:0 | ||||
| 14. Round | 17/11/2012 | KSV Roeselare | - | KVC Westerlo | 1:1 | ||||
| 16. Round | 02/12/2012 | KVC Westerlo | - | Sint-Truidense VV | 4:1 | ||||
| 17. Round | 19/12/2012 | KV Oostende | - | KVC Westerlo | 2:1 | ||||
| 33. Round | 21/04/2013 | Sint-Truidense VV | - | KVC Westerlo | 0:2 | ||||
| 34. Round | 28/04/2013 | KVC Westerlo | - | KV Oostende | 0:0 |
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