| 6. Round | 29/08/2012 | La Equidad | - | Independiente Medellín | 1:3 | ||||
| 7. Round | 02/09/2012 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 0:3 |  |
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| 8. Round | 15/09/2012 | Once Caldas | - | Independiente Medellín | 0:1 | ||||
| 9. Round | 23/09/2012 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 2:2 | ||||
| 10. Round | 27/09/2012 | Independiente Medellín | - | Real Cartagena | 5:0 | ||||
| 11. Round | 30/09/2012 | Deportivo Cali | - | Independiente Medellín | 2:0 | |
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| 12. Round | 04/10/2012 | Independiente Medellín | - | Itagüi Ditaires | 0:1 | ||||
| 13. Round | 07/10/2012 | Boyacá Chicó | - | Independiente Medellín | 1:0 | ||||
| 14. Round | 14/10/2012 | Independiente Medellín | - | Millonarios | 1:1 | |
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| 16. Round | 28/10/2012 | Independiente Medellín | - | Cúcuta Deportivo | 1:1 | ||||
| 17. Round | 04/11/2012 | Independiente Medellín | - | Atlético Junior | 2:1 |  |
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| 18. Round | 11/11/2012 | Deportes Quindío | - | Independiente Medellín | 1:3 |
Colombia