| 7. Round | 14/09/2012 | AJ Auxerre | - | FC Istres | 0:0 | ||||
| 12. Round | 26/10/2012 | FC Istres | - | Tours FC | 4:1 | ||||
| 16. Round | 03/12/2012 | EA Guingamp | - | FC Istres | 1:0 | ||||
| 19. Round | 21/12/2012 | FC Istres | - | RC Lens | 2:2 | ||||
| 20. Round | 11/01/2013 | Gazélec FC Ajaccio | - | FC Istres | 3:2 | ||||
| 22. Round | 26/01/2013 | LB Châteauroux | - | FC Istres | 2:0 | ||||
| 27. Round | 01/03/2013 | FC Istres | - | CS Sedan | 1:0 | ||||
| 29. Round | 15/03/2013 | FC Istres | - | Clermont Foot Auvergne 63 | 0:0 | ||||
| 28. Round | 24/03/2013 | SM Caen | - | FC Istres | 1:0 | ||||
| 30. Round | 29/03/2013 | Tours FC | - | FC Istres | 1:0 |
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