| 8. Round | 20/03/2016 | Atlético Paraná | - | Boca Unidos | 0:2 |  |
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| 9. Round | 27/03/2016 | Boca Unidos | - | Villa Dálmine | 3:1 |  |
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| 10. Round | 02/04/2016 | Douglas Haig | - | Boca Unidos | 1:3 | ||||
| 11. Round | 10/04/2016 | Boca Unidos | - | Juventud Unida Universitario | 0:0 | ||||
| 12. Round | 17/04/2016 | Estudiantes de San Luis | - | Boca Unidos | 0:1 | ||||
| 15. Round | 08/05/2016 | Boca Unidos | - | Ferro Carril Oeste | 2:0 | |
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| 17. Round | 22/05/2016 | Boca Unidos | - | Instituto de Córdoba | 3:0 | ||||
| 18. Round | 28/05/2016 | Talleres de Córdoba | - | Boca Unidos | 2:0 | ||||
| 19. Round | 05/06/2016 | Boca Unidos | - | Nueva Chicago | 2:1 | |
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| 20. Round | 12/06/2016 | All Boys | - | Boca Unidos | 3:0 | ||||
| 21. Round | 17/06/2016 | Boca Unidos | - | Crucero del Norte | 2:2 |
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