| 5. Round | 07/04/2016 | Atlético Nacional | - | Fortaleza FC | 4:1 |  |
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| 14. Round | 23/04/2016 | Cortuluá | - | Atlético Nacional | 2:0 | ||||
| 16. Round | 01/05/2016 | Atlético Huila | - | Atlético Nacional | 0:1 | ||||
| 17. Round | 07/05/2016 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 1:2 | ||||
| 18. Round | 15/05/2016 | Patriotas FC | - | Atlético Nacional | 2:2 | ||||
| 19. Round | 22/05/2016 | Atlético Nacional | - | Santa Fe | 0:1 | ||||
| 15. Round | 26/05/2016 | Atlético Nacional | - | La Equidad | 3:0 | ||||
| 20. Round | 29/05/2016 | Deportivo Pasto | - | Atlético Nacional | 0:2 |
Colombia