| 3. Round | 14/07/2016 | Santa Fe | - | Atlético Bucaramanga | 1:0 | ||||
| 5. Round | 25/07/2016 | Santa Fe | - | Envigado FC | 2:0 |  |
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| 6. Round | 01/08/2016 | Cortuluá | - | Santa Fe | 0:1 | ||||
| 8. Round | 15/08/2016 | Atlético Huila | - | Santa Fe | 1:0 |  |
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| 9. Round | 21/08/2016 | Santa Fe | - | Independiente Medellín | 1:1 | |
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| 10. Round | 29/08/2016 | Santa Fe | - | Millonarios | 1:2 | |
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| 7. Round | 03/09/2016 | Santa Fe | - | La Equidad | 1:1 | ||||
| 11. Round | 12/09/2016 | Patriotas FC | - | Santa Fe | 2:0 | ||||
| 12. Round | 16/09/2016 | Santa Fe | - | Deportivo Cali | 2:2 | ||||
| 13. Round | 19/09/2016 | Deportivo Pasto | - | Santa Fe | 0:1 | ||||
| 14. Round | 25/09/2016 | Alianza Petrolera | - | Santa Fe | 0:1 | |
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| 15. Round | 08/10/2016 | Santa Fe | - | Jaguares de Córdoba | 1:0 |
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