| 10. Round | 13/09/2008 | Cienciano | - | Sport Áncash | 0:1 | ||||
| 11. Round | 18/09/2008 | Alianza Lima | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 12. Round | 21/09/2008 | Coronel Bolognesi | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 13. Round | 28/09/2008 | Cienciano | - | Alianza Atlético | 2:1 |  |
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| 14. Round | 06/10/2008 | Universidad Cesar Vallejo | - | Cienciano | 0:1 |  |
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| 15. Round | 19/10/2008 | Cienciano | - | Sport Boys | 4:1 | |
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| 16. Round | 22/10/2008 | José Gálvez | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 17. Round | 26/10/2008 | Cienciano | - | FBC Melgar | 3:1 | ||||
| 18. Round | 01/11/2008 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 1:1 | ||||
| 19. Round | 05/11/2008 | Cienciano | - | Universidad San Martín | 2:1 | ||||
| 20. Round | 09/11/2008 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 2:1 |
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