| 1. Round | 29/07/2012 | Boyacá Chicó | - | Atlético Huila | 2:0 | ||||
| 2. Round | 05/08/2012 | La Equidad | - | Boyacá Chicó | 1:1 | ||||
| 3. Round | 12/08/2012 | Boyacá Chicó | - | Atlético Nacional | 1:1 |  |
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| 4. Round | 20/08/2012 | Once Caldas | - | Boyacá Chicó | 5:2 |  |
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| 5. Round | 26/08/2012 | Boyacá Chicó | - | Real Cartagena | 3:0 | ||||
| 6. Round | 30/08/2012 | Deportivo Cali | - | Boyacá Chicó | 2:3 | |
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| 8. Round | 17/09/2012 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 1:1 | ||||
| 7. Round | 20/09/2012 | Boyacá Chicó | - | Itagüi Ditaires | 1:1 | ||||
| 9. Round | 22/09/2012 | Patriotas FC | - | Boyacá Chicó | 1:0 | ||||
| 10. Round | 27/09/2012 | Millonarios | - | Boyacá Chicó | 0:1 | ||||
| 11. Round | 29/09/2012 | Boyacá Chicó | - | Deportes Tolima | 1:1 | |
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| 12. Round | 03/10/2012 | Cúcuta Deportivo | - | Boyacá Chicó | 2:0 | ||||
| 13. Round | 07/10/2012 | Boyacá Chicó | - | Independiente Medellín | 1:0 | |
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| 14. Round | 14/10/2012 | Deportes Quindío | - | Boyacá Chicó | 4:1 | ||||
| 15. Round | 21/10/2012 | Boyacá Chicó | - | Deportivo Pasto | 1:1 | ||||
| 16. Round | 27/10/2012 | Envigado FC | - | Boyacá Chicó | 0:0 | ||||
| 17. Round | 04/11/2012 | Boyacá Chicó | - | Patriotas FC | 0:1 | ||||
| 18. Round | 11/11/2012 | Santa Fe | - | Boyacá Chicó | 1:0 |
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