| 2. Round | 23/07/2016 | Cruz Azul | - | Pumas UNAM | 0:0 | ||||
| 3. Round | 31/07/2016 | CF Monterrey | - | Cruz Azul | 1:1 | ||||
| 4. Round | 06/08/2016 | Cruz Azul | - | Club Tijuana | 1:2 |  |
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| 6. Round | 20/08/2016 | Cruz Azul | - | Santos Laguna | 3:1 |  |
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| 7. Round | 28/08/2016 | Atlas Guadalajara | - | Cruz Azul | 1:1 | ||||
| 8. Round | 10/09/2016 | Cruz Azul | - | CF América | 3:4 | ||||
| 9. Round | 18/09/2016 | Chiapas FC | - | Cruz Azul | 0:3 | |
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| 10. Round | 21/09/2016 | Cruz Azul | - | Deportivo Toluca | 0:1 | ||||
| 11. Round | 25/09/2016 | UANL Tigres | - | Cruz Azul | 0:0 | ||||
| 12. Round | 01/10/2016 | Cruz Azul | - | CD Veracruz | 5:3 | ||||
| 13. Round | 16/10/2016 | Monarcas Morelia | - | Cruz Azul | 1:1 | |
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| 14. Round | 22/10/2016 | Cruz Azul | - | Puebla FC | 1:2 | |
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