| 1. Round | 29/07/2016 | Lokomotiv Gorna Oryahovitsa | - | Neftochimik Burgas | 0:0 | ||||
| 2. Round | 05/08/2016 | Neftochimik Burgas | - | FC Dunav Ruse | 1:2 | ||||
| 3. Round | 14/08/2016 | CSKA Sofia | - | Neftochimik Burgas | 5:1 | ||||
| 4. Round | 21/08/2016 | Neftochimik Burgas | - | PFC Beroe | 1:0 | ||||
| 5. Round | 27/08/2016 | Botev Plovdiv | - | Neftochimik Burgas | 2:1 | ||||
| 6. Round | 10/09/2016 | Neftochimik Burgas | - | Levski Sofia | 1:2 | ||||
| 9. Round | 02/10/2016 | PFC Ludogorets Razgrad | - | Neftochimik Burgas | 3:1 | ||||
| 11. Round | 23/10/2016 | FK Vereya | - | Neftochimik Burgas | 1:1 | ||||
| 13. Round | 04/11/2016 | Neftochimik Burgas | - | Pirin Blagoevgrad | 3:1 |  |
 |
||
| 14. Round | 21/11/2016 | Neftochimik Burgas | - | Lokomotiv Gorna Oryahovitsa | 1:1 | ||||
| 22. Round | 01/03/2017 | Neftochimik Burgas | - | PFC Ludogorets Razgrad | 1:1 | ||||
| 23. Round | 05/03/2017 | Slavia Sofia | - | Neftochimik Burgas | 0:3 | ||||
| 26. Round | 31/03/2017 | Pirin Blagoevgrad | - | Neftochimik Burgas | 1:0 |
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