| 1. Round | 06/08/2016 | AZAL PFK Baku | - | Neftçi PFK | 0:2 | ||||
| 2. Round | 14/08/2016 | Neftçi PFK | - | Zira FK | 0:1 | ||||
| 3. Round | 21/08/2016 | Qarabağ FK | - | Neftçi PFK | 3:0 | ||||
| 4. Round | 10/09/2016 | Neftçi PFK | - | Gabala FK | 0:8 | ||||
| 5. Round | 18/09/2016 | Inter Baku | - | Neftçi PFK | 2:1 | ||||
| 6. Round | 27/09/2016 | Neftçi PFK | - | Sumgayıt FK | 1:2 | ||||
| 7. Round | 01/10/2016 | Neftçi PFK | - | Kapaz PFK | 2:0 | ||||
| 8. Round | 16/10/2016 | Zira FK | - | Neftçi PFK | 2:0 |
Croatia