| 1. Round | 29/07/2016 | Lokomotiv Gorna Oryahovitsa | - | Neftochimik Burgas | 0:0 |  |
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| 2. Round | 05/08/2016 | Neftochimik Burgas | - | FC Dunav Ruse | 1:2 | |
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| 3. Round | 14/08/2016 | CSKA Sofia | - | Neftochimik Burgas | 5:1 | ||||
| 4. Round | 21/08/2016 | Neftochimik Burgas | - | PFC Beroe | 1:0 | |
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| 5. Round | 27/08/2016 | Botev Plovdiv | - | Neftochimik Burgas | 2:1 | ||||
| 6. Round | 10/09/2016 | Neftochimik Burgas | - | Levski Sofia | 1:2 | |
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| 12. Round | 30/10/2016 | Cherno More Varna | - | Neftochimik Burgas | 3:1 | ||||
| 14. Round | 21/11/2016 | Neftochimik Burgas | - | Lokomotiv Gorna Oryahovitsa | 1:1 | ||||
| 15. Round | 27/11/2016 | FC Dunav Ruse | - | Neftochimik Burgas | 3:0 | ||||
| 16. Round | 01/12/2016 | Neftochimik Burgas | - | CSKA Sofia | 0:2 | |
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| 18. Round | 09/12/2016 | Neftochimik Burgas | - | Botev Plovdiv | 4:0 |  |
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| 19. Round | 14/12/2016 | Levski Sofia | - | Neftochimik Burgas | 1:0 | ||||
| 20. Round | 18/02/2017 | Neftochimik Burgas | - | PFC Montana | 2:0 | ||||
| 24. Round | 13/03/2017 | Neftochimik Burgas | - | FK Vereya | 1:0 | ||||
| 26. Round | 31/03/2017 | Pirin Blagoevgrad | - | Neftochimik Burgas | 1:0 |
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