| 1. Round | 18/07/2021 | Sport Boys | - | Cienciano | 1:4 | ||||
| 4. Round | 03/08/2021 | Cienciano | - | Deportivo Municipal | 2:3 | ||||
| 5. Round | 09/08/2021 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 3:1 | ||||
| 6. Round | 15/08/2021 | Cienciano | - | Sport Huancayo | 0:0 | ||||
| 7. Round | 17/08/2021 | Universidad Cesar Vallejo | - | Cienciano | 0:1 | ||||
| 8. Round | 22/08/2021 | Cienciano | - | Deportivo Binacional | 2:0 |  |
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| 9. Round | 27/08/2021 | Cusco FC | - | Cienciano | 3:0 dec. | ||||
| 10. Round | 13/09/2021 | Cienciano | - | FBC Melgar | 0:1 | ||||
| 11. Round | 17/09/2021 | Alianza Atlético | - | Cienciano | 2:2 | ||||
| 16. Round | 22/10/2021 | Ayacucho FC | - | Cienciano | 1:3 | ||||
| 17. Round | 29/10/2021 | Cienciano | - | Alianza Lima | 1:1 |
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