| 1. Round | 21/01/2024 | Atlético Junior | - | Atlético Bucaramanga | 2:0 | ||||
| 2. Round | 28/01/2024 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 2:2 |  |
|||
| 3. Round | 02/02/2024 | Atlético Junior | - | Independiente Medellín | 3:0 | ||||
| 4. Round | 05/02/2024 | Alianza FC | - | Atlético Junior | 0:1 | ||||
| 6. Round | 11/02/2024 | Fortaleza FC | - | Atlético Junior | 2:0 | ||||
| 7. Round | 19/02/2024 | Atlético Junior | - | Deportes Tolima | 0:1 | ||||
| 8. Round | 22/02/2024 | Santa Fe | - | Atlético Junior | 3:0 | ||||
| 9. Round | 26/02/2024 | Deportivo Pereira | - | Atlético Junior | 3:3 | ||||
| 10. Round | 03/03/2024 | Atlético Junior | - | Atlético Nacional | 0:0 | ||||
| 16. Round | 14/04/2024 | Atlético Junior | - | Envigado FC | 1:1 | ||||
| 17. Round | 18/04/2024 | Millonarios | - | Atlético Junior | 3:2 | ||||
| 18. Round | 21/04/2024 | Atlético Junior | - | Once Caldas | 1:0 | ||||
| 19. Round | 28/04/2024 | Deportivo Cali | - | Atlético Junior | 0:0 |
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