| Group B | 21/08/2016 | Ayacucho FC | - | Alianza Lima | 1:1 | ||||
| Group B | 26/08/2016 | Alianza Lima | - | Universidad Técnica | 2:1 | ||||
| Group B | 11/09/2016 | Universidad San Martín | - | Alianza Lima | 3:0 | ||||
| Group B | 18/09/2016 | Alianza Lima | - | Universitario de Deportes | 1:1 |  |
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| Group B | 25/09/2016 | Alianza Lima | - | Alianza Atlético | 0:0 | ||||
| Group B | 28/09/2016 | Comerciantes Unidos | - | Alianza Lima | 2:1 | ||||
| Group B | 16/10/2016 | Alianza Lima | - | Sport Huancayo | 1:0 | ||||
| Group B | 22/10/2016 | Universidad Técnica | - | Alianza Lima | 0:2 | ||||
| Group B | 30/10/2016 | Alianza Lima | - | Universidad San Martín | 1:2 | ||||
| Group B | 13/11/2016 | Alianza Lima | - | Ayacucho FC | 0:1 | ||||
| Group B | 20/11/2016 | Alianza Atlético | - | Alianza Lima | 4:0 |  |
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