| 3. Round | 28/07/2012 | Zlaté Moravce | - | FC Nitra | 0:2 | ||||
| 5. Round | 11/08/2012 | Zlaté Moravce | - | 1. FC Tatran Prešov | 2:0 | ||||
| 6. Round | 18/08/2012 | MFK Košice | - | Zlaté Moravce | 2:1 |  |
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| 7. Round | 25/08/2012 | Zlaté Moravce | - | MŠK Žilina | 1:0 | ||||
| 9. Round | 15/09/2012 | Zlaté Moravce | - | Slovan Bratislava | 3:1 | ||||
| 10. Round | 22/09/2012 | FK Senica | - | Zlaté Moravce | 3:0 | ||||
| 11. Round | 29/09/2012 | Zlaté Moravce | - | AS Trenčín | 4:1 | ||||
| 15. Round | 03/11/2012 | Zlaté Moravce | - | FK Dukla Banská Bystrica | 2:0 |  |
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| 16. Round | 10/11/2012 | 1. FC Tatran Prešov | - | Zlaté Moravce | 1:1 | |
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| 17. Round | 16/11/2012 | Zlaté Moravce | - | MFK Košice | 1:0 | ||||
| 18. Round | 23/11/2012 | MŠK Žilina | - | Zlaté Moravce | 4:1 | ||||
| 19. Round | 01/12/2012 | Zlaté Moravce | - | Spartak Trnava | 1:1 | ||||
| 20. Round | 01/03/2013 | Slovan Bratislava | - | Zlaté Moravce | 4:1 |
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