| 2. Round | 02/02/2025 | Independiente Medellín | - | Boyacá Chicó | 3:0 | ||||
| 6. Round | 28/02/2025 | Independiente Medellín | - | Llaneros FC | 3:0 | ||||
| 7. Round | 04/03/2025 | Independiente Medellín | - | Deportivo Pasto | 1:0 | ||||
| 8. Round | 09/03/2025 | La Equidad | - | Independiente Medellín | 0:0 | ||||
| 9. Round | 16/03/2025 | Independiente Medellín | - | Deportivo Cali | 0:0 | ||||
| 10. Round | 23/03/2025 | Atlético Nacional | - | Independiente Medellín | 1:1 | ||||
| 11. Round | 30/03/2025 | Independiente Medellín | - | Águilas Doradas | 0:0 | ||||
| 15. Round | 20/04/2025 | Independiente Medellín | - | Once Caldas | 2:0 | ||||
| 17. Round | 04/05/2025 | Independiente Medellín | - | Atlético Nacional | 1:1 |  |
|||
| 18. Round | 10/05/2025 | Atlético Bucaramanga | - | Independiente Medellín | 2:0 | ||||
| 13. Round | 16/05/2025 | Independiente Medellín | - | Deportes Tolima | 0:1 | ||||
| 19. Round | 20/05/2025 | Independiente Medellín | - | Deportivo Pereira | 2:0 | ||||
| 20. Round | 25/05/2025 | América de Cali | - | Independiente Medellín | 2:0 |
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