| 1. Round | 14/02/2010 | Alianza Atlético | - | Cienciano | 2:1 | ||||
| 6. Round | 21/03/2010 | Cienciano | - | FBC Melgar | 1:1 | ||||
| 7. Round | 29/03/2010 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 8. Round | 04/04/2010 | Cienciano | - | León de Huánuco | 2:1 | ||||
| 9. Round | 10/04/2010 | José Gálvez | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 11. Round | 24/04/2010 | Inti Gas | - | Cienciano | 3:1 | ||||
| 12. Round | 02/05/2010 | CN Iquitos | - | Cienciano | 1:0 | ||||
| 13. Round | 11/05/2010 | Cienciano | - | Alianza Lima | 2:1 | ||||
| 15. Round | 22/05/2010 | Sporting Cristal | - | Cienciano | 0:1 | ||||
| 16. Round | 30/05/2010 | Cienciano | - | Alianza Atlético | 0:0 |  |
|||
| 17. Round | 05/06/2010 | Universidad San Martín | - | Cienciano | 3:0 | ||||
| 18. Round | 09/06/2010 | Cienciano | - | Sport Boys | 2:0 | ||||
| 19. Round | 13/06/2010 | Sport Huancayo | - | Cienciano | 1:1 | ||||
| 20. Round | 20/06/2010 | Cienciano | - | Universidad Cesar Vallejo | 2:0 | ||||
| 21. Round | 29/06/2010 | FBC Melgar | - | Cienciano | 3:0 | ||||
| 22. Round | 04/07/2010 | Cienciano | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| 25. Round | 25/07/2010 | Juan Aurich | - | Cienciano | 5:2 |
Peru