| 3. Round | 24/02/2025 | Deportivo Binacional | - | Cusco FC | 1:2 | ||||
| 4. Round | 01/03/2025 | Alianza Atlético | - | Deportivo Binacional | 4:1 | ||||
| 5. Round | 10/03/2025 | Deportivo Binacional | - | Juan Pablo II College | 2:0 | ||||
| 7. Round | 04/04/2025 | Deportivo Binacional | - | Ayacucho FC | 1:1 | ||||
| 8. Round | 13/04/2025 | AD Tarma | - | Deportivo Binacional | 1:1 |  |
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| 9. Round | 18/04/2025 | Deportivo Binacional | - | Universitario de Deportes | 1:3 |  |
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| 10. Round | 27/04/2025 | Deportivo Garcilaso | - | Deportivo Binacional | 0:1 | |
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| 11. Round | 05/05/2025 | Deportivo Binacional | - | Los Chankas | 1:2 | |
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| 12. Round | 09/05/2025 | Comerciantes Unidos | - | Deportivo Binacional | 1:1 | ||||
| 13. Round | 19/05/2025 | Deportivo Binacional | - | Cienciano | 1:1 | ||||
| 14. Round | 24/05/2025 | Atlético Grau | - | Deportivo Binacional | 3:0 |
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