| 1. Round | 21/08/2016 | CD Numancia | - | Levante UD | 0:1 | ||||
| 2. Round | 26/08/2016 | Getafe CF | - | CD Numancia | 0:0 | ||||
| 4. Round | 10/09/2016 | CF Reus Deportiu | - | CD Numancia | 1:1 |  |
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| 5. Round | 17/09/2016 | CD Numancia | - | Gimnàstic de Tarragona | 1:0 | ||||
| 6. Round | 20/09/2016 | Cádiz CF | - | CD Numancia | 1:0 | ||||
| 7. Round | 25/09/2016 | CD Numancia | - | Real Zaragoza | 2:1 | ||||
| 8. Round | 02/10/2016 | Real Oviedo | - | CD Numancia | 2:2 | ||||
| 10. Round | 16/10/2016 | Rayo Vallecano | - | CD Numancia | 3:3 | ||||
| 12. Round | 30/10/2016 | Girona FC | - | CD Numancia | 3:0 | ||||
| 13. Round | 06/11/2016 | CD Numancia | - | Elche CF | 2:2 | ||||
| 16. Round | 26/11/2016 | UCAM Murcia CF | - | CD Numancia | 3:2 | |
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| 17. Round | 03/12/2016 | CD Numancia | - | UD Almería | 1:0 | ||||
| 18. Round | 11/12/2016 | CD Lugo | - | CD Numancia | 3:1 |
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