| 12. Round | 24/10/2009 | NK Međimurje | - | NK Zagreb | 4:2 | ||||
| 13. Round | 31/10/2009 | HNK Cibalia | - | NK Međimurje | 3:0 | ||||
| 18. Round | 27/02/2010 | NK Istra 1961 | - | NK Međimurje | 1:2 | ||||
| 19. Round | 06/03/2010 | NK Croatia Sesvete | - | NK Međimurje | 2:1 | ||||
| 20. Round | 13/03/2010 | NK Međimurje | - | NK Osijek | 1:1 | ||||
| 21. Round | 20/03/2010 | NK Zadar | - | NK Međimurje | 2:0 | ||||
| 22. Round | 27/03/2010 | NK Međimurje | - | Slaven Belupo | 1:1 | ||||
| 23. Round | 02/04/2010 | NK Inter Zaprešić | - | NK Međimurje | 2:1 | ||||
| 24. Round | 10/04/2010 | NK Međimurje | - | HNK Rijeka | 1:5 |  |
Croatia