| 20. Round | 19/01/2024 | FK Kukësi | - | Egnatia Rrogozhine | 1:4 | ||||
| 21. Round | 29/01/2024 | FC Dinamo City | - | FK Kukësi | 3:2 | ||||
| 23. Round | 11/02/2024 | KF Skënderbeu | - | FK Kukësi | 1:0 | ||||
| 24. Round | 16/02/2024 | KF Teuta Durrës | - | FK Kukësi | 1:0 | ||||
| 25. Round | 25/02/2024 | FK Kukësi | - | Erzeni Shijak | 1:2 | ||||
| 26. Round | 01/03/2024 | FK Partizani | - | FK Kukësi | 3:0 | ||||
| 27. Round | 11/03/2024 | FK Kukësi | - | KF Laçi | 1:0 | ||||
| 28. Round | 17/03/2024 | FK Kukësi | - | FK Vllaznia | 2:0 |  |
|||
| 29. Round | 29/03/2024 | Egnatia Rrogozhine | - | FK Kukësi | 1:0 | ||||
| 30. Round | 07/04/2024 | FK Kukësi | - | FC Dinamo City | 1:1 | ||||
| 31. Round | 13/04/2024 | KF Tiranë | - | FK Kukësi | 1:0 | ||||
| 32. Round | 19/04/2024 | FK Kukësi | - | KF Skënderbeu | 0:2 | ||||
| 33. Round | 28/04/2024 | FK Kukësi | - | KF Teuta Durrës | 0:2 | ||||
| 34. Round | 04/05/2024 | Erzeni Shijak | - | FK Kukësi | 3:3 | |
|||
| 35. Round | 08/05/2024 | FK Kukësi | - | FK Partizani | 0:1 |
Moldova