| 2. Round | 22/08/2020 | HNK Cibalia | - | NK Međimurje | 3:3 | ||||
| 1. Round | 02/09/2020 | NK Međimurje | - | NK Rudeš | 4:0 | ||||
| 4. Round | 12/09/2020 | HNK Orijent Rijeka | - | NK Međimurje | 0:1 | ||||
| 5. Round | 16/09/2020 | NK Međimurje | - | Hrvatski Dragovoljac | 1:1 | ||||
| 6. Round | 20/09/2020 | NK Osijek II | - | NK Međimurje | 6:0 | ||||
| 7. Round | 26/09/2020 | NK Međimurje | - | NK Junak Sinj | 4:3 | ||||
| 9. Round | 03/10/2020 | NK Međimurje | - | NK Croatia Zmijavci | 2:1 | ||||
| 10. Round | 16/10/2020 | NK Međimurje | - | NK Inter Zaprešić | 3:2 | ||||
| 11. Round | 24/10/2020 | NK Kustošija | - | NK Međimurje | 0:0 | ||||
| 12. Round | 30/10/2020 | NK Međimurje | - | NK Opatija | 3:0 | ||||
| 14. Round | 20/11/2020 | NK Međimurje | - | NK BSK Bijelo Brdo | 2:5 | ||||
| 15. Round | 29/11/2020 | Hajduk Split II | - | NK Međimurje | 4:0 | ||||
| 13. Round | 02/12/2020 | Dinamo Zagreb II | - | NK Međimurje | 5:2 |
Croatia