| 4. Round | 20/09/2003 | CD Alavés | - | Atlético Malagueño | 1:0 |  |
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| 5. Round | 26/09/2003 | Getafe CF | - | CD Alavés | 0:0 | ||||
| 8. Round | 18/10/2003 | Recreativo Huelva | - | CD Alavés | 0:0 | |
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| 9. Round | 25/10/2003 | CD Alavés | - | Córdoba CF | 1:0 | |
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| 10. Round | 01/11/2003 | UD Salamanca | - | CD Alavés | 3:1 | |
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| 12. Round | 14/11/2003 | Levante UD | - | CD Alavés | 0:0 | ||||
| 13. Round | 22/11/2003 | CD Alavés | - | Xerez CD | 1:1 | |
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| 16. Round | 12/12/2003 | Rayo Vallecano | - | CD Alavés | 1:2 | ||||
| 18. Round | 03/01/2004 | CD Leganés | - | CD Alavés | 0:0 | ||||
| 19. Round | 10/01/2004 | CD Alavés | - | CD Numancia | 1:1 | ||||
| 20. Round | 17/01/2004 | Ciudad de Murcia | - | CD Alavés | 0:1 | ||||
| 21. Round | 24/01/2004 | CD Alavés | - | SD Eibar | 0:2 | ||||
| 23. Round | 07/02/2004 | Sporting Gijón | - | CD Alavés | 2:0 | ||||
| 25. Round | 20/02/2004 | Atlético Malagueño | - | CD Alavés | 2:1 | |
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