| 3. Round | 11/09/2016 | Sporting Gijón | - | CD Leganés | 2:1 | ||||
| 4. Round | 17/09/2016 | CD Leganés | - | FC Barcelona | 1:5 |  |
|||
| 5. Round | 22/09/2016 | Deportivo La Coruña | - | CD Leganés | 1:2 | ||||
| 6. Round | 25/09/2016 | CD Leganés | - | Valencia CF | 1:2 | ||||
| 7. Round | 01/10/2016 | Granada CF | - | CD Leganés | 0:1 | ||||
| 8. Round | 15/10/2016 | CD Leganés | - | Sevilla FC | 2:3 | ||||
| 9. Round | 23/10/2016 | Málaga CF | - | CD Leganés | 4:0 | ||||
| 10. Round | 28/10/2016 | CD Leganés | - | Real Sociedad | 0:2 | ||||
| 11. Round | 06/11/2016 | Real Madrid | - | CD Leganés | 3:0 | |
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| 13. Round | 26/11/2016 | Espanyol Barcelona | - | CD Leganés | 3:0 | ||||
| 14. Round | 03/12/2016 | CD Leganés | - | Villarreal CF | 0:0 | |
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| 15. Round | 10/12/2016 | UD Las Palmas | - | CD Leganés | 1:1 | ||||
| 16. Round | 18/12/2016 | CD Leganés | - | SD Eibar | 1:1 | ||||
| 17. Round | 08/01/2017 | Real Betis | - | CD Leganés | 2:0 | |
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| 18. Round | 14/01/2017 | CD Leganés | - | Athletic Club | 0:0 |
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