| 1. Round | 09/02/2025 | Alianza Lima | - | Cusco FC | 3:0 | ||||
| 2. Round | 14/02/2025 | Cusco FC | - | FBC Melgar | 0:1 | ||||
| 3. Round | 24/02/2025 | Deportivo Binacional | - | Cusco FC | 1:2 | ||||
| 4. Round | 01/03/2025 | Cusco FC | - | Universidad Técnica | 1:1 | ||||
| 6. Round | 28/03/2025 | Alianza Atlético | - | Cusco FC | 2:4 |  |
|||
| 7. Round | 06/04/2025 | Cusco FC | - | Juan Pablo II College | 4:2 | ||||
| 9. Round | 20/04/2025 | Cusco FC | - | Ayacucho FC | 3:0 | ||||
| 10. Round | 28/04/2025 | AD Tarma | - | Cusco FC | 2:1 | ||||
| 14. Round | 24/05/2025 | Comerciantes Unidos | - | Cusco FC | 1:2 |
USA
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