| 7. Round | 18/09/2016 | PFC Beroe | - | FC Dunav Ruse | 0:0 | ||||
| 8. Round | 25/09/2016 | CSKA Sofia | - | PFC Beroe | 4:0 | ||||
| 9. Round | 30/09/2016 | PFC Beroe | - | Cherno More Varna | 0:1 | ||||
| 10. Round | 16/10/2016 | PFC Beroe | - | Botev Plovdiv | 3:4 | ||||
| 11. Round | 22/10/2016 | Levski Sofia | - | PFC Beroe | 2:0 | ||||
| 12. Round | 29/10/2016 | PFC Beroe | - | PFC Montana | 2:1 | ||||
| 13. Round | 02/11/2016 | Lokomotiv Plovdiv | - | PFC Beroe | 1:1 | ||||
| 1. Round | 16/11/2016 | PFC Beroe | - | PFC Ludogorets Razgrad | 0:2 | ||||
| 14. Round | 19/11/2016 | PFC Ludogorets Razgrad | - | PFC Beroe | 1:0 | ||||
| 15. Round | 27/11/2016 | PFC Beroe | - | Slavia Sofia | 1:1 | ||||
| 16. Round | 01/12/2016 | FK Vereya | - | PFC Beroe | 1:0 | ||||
| 17. Round | 04/12/2016 | PFC Beroe | - | Neftochimik Burgas | 2:0 | ||||
| 18. Round | 12/12/2016 | Pirin Blagoevgrad | - | PFC Beroe | 1:1 | ||||
| 19. Round | 15/12/2016 | PFC Beroe | - | Lokomotiv Gorna Oryahovitsa | 1:1 | ||||
| 26. Round | 01/04/2017 | PFC Beroe | - | Lokomotiv Plovdiv | 3:2 |
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