| 3. Round | 30/07/2016 | Újpest FC | - | Paksi SE | 1:0 | ||||
| 4. Round | 06/08/2016 | Paksi SE | - | Ferencvárosi TC | 0:0 | ||||
| 5. Round | 13/08/2016 | Budapest Honvéd | - | Paksi SE | 3:1 | ||||
| 6. Round | 17/08/2016 | Paksi SE | - | Diósgyöri VTK | 2:1 | ||||
| 7. Round | 21/08/2016 | Szombathelyi Haladás | - | Paksi SE | 3:1 | ||||
| 8. Round | 10/09/2016 | Budapesti Vasas | - | Paksi SE | 1:0 | ||||
| 9. Round | 17/09/2016 | Paksi SE | - | Gyirmót FC | 0:0 | ||||
| 12. Round | 15/10/2016 | Paksi SE | - | Debreceni VSC | 1:1 | ||||
| 14. Round | 29/10/2016 | Paksi SE | - | Újpest FC | 1:1 | ||||
| 17. Round | 26/11/2016 | Diósgyöri VTK | - | Paksi SE | 2:0 | ||||
| 20. Round | 18/02/2017 | Gyirmót FC | - | Paksi SE | 0:0 | ||||
| 26. Round | 12/04/2017 | Paksi SE | - | Ferencvárosi TC | 3:1 | ||||
| 28. Round | 22/04/2017 | Paksi SE | - | Diósgyöri VTK | 0:1 | ||||
| 32. Round | 20/05/2017 | Mezőkövesdi SE | - | Paksi SE | 3:2 |
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