| Group B | 24/08/2016 | Comerciantes Unidos | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Group B | 11/09/2016 | Universitario de Deportes | - | Sport Huancayo | 1:0 | ||||
| Group B | 18/09/2016 | Alianza Lima | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Group B | 20/11/2016 | Universitario de Deportes | - | Universidad Técnica | 1:1 | ||||
| Group B | 23/11/2016 | Ayacucho FC | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| Group B | 27/11/2016 | Universitario de Deportes | - | Universidad San Martín | 0:1 |  |
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