| 19. Round | 21/02/2021 | Sileks Kratovo | - | KF Shkëndija 79 | 1:2 | ||||
| 20. Round | 28/02/2021 | KF Shkëndija 79 | - | Vardar Skopje | 2:1 | ||||
| 21. Round | 03/03/2021 | FK Rabotnički | - | KF Shkëndija 79 | 0:0 | ||||
| 22. Round | 07/03/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Renova | 0:0 | ||||
| 23. Round | 14/03/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 1:0 | ||||
| 24. Round | 20/03/2021 | Vardar Skopje | - | KF Shkëndija 79 | 1:6 |  |
|||
| 25. Round | 04/04/2021 | KF Shkëndija 79 | - | Sileks Kratovo | 2:1 | ||||
| 26. Round | 11/04/2021 | FK Renova | - | KF Shkëndija 79 | 0:3 | ||||
| 27. Round | 14/04/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK AP Brera Strumica | 1:0 | ||||
| 28. Round | 18/04/2021 | FK Belasica | - | KF Shkëndija 79 | 0:3 | |
|||
| 29. Round | 25/04/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Borec | 3:1 | |
|||
| 30. Round | 28/04/2021 | FK Rabotnički | - | KF Shkëndija 79 | 3:5 | |
|||
| 31. Round | 01/05/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FC Struga | 0:2 | ||||
| 32. Round | 09/05/2021 | Makedonija GP | - | KF Shkëndija 79 | 3:4 | ||||
| 33. Round | 16/05/2021 | KF Shkëndija 79 | - | KF Shkupi | 1:1 |
Albania