| 1. Round | 08/08/2021 | GFK Tikvesh | - | KF Shkëndija 79 | 0:0 | ||||
| 2. Round | 15/08/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Renova | 1:2 | ||||
| 3. Round | 18/08/2021 | FK Bregalnica Štip | - | KF Shkëndija 79 | 3:3 | ||||
| 4. Round | 22/08/2021 | KF Shkëndija 79 | - | Makedonija GP | 4:0 | ||||
| 5. Round | 28/08/2021 | FK Pelister | - | KF Shkëndija 79 | 2:2 | ||||
| 6. Round | 14/09/2021 | KF Shkëndija 79 | - | KF Shkupi | 0:0 | ||||
| 9. Round | 02/10/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Borec | 3:0 | ||||
| 10. Round | 16/10/2021 | FK AP Brera Strumica | - | KF Shkëndija 79 | 2:1 | ||||
| 11. Round | 24/10/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Rabotnički | 2:0 | ||||
| 12. Round | 30/10/2021 | KF Shkëndija 79 | - | GFK Tikvesh | 1:1 | ||||
| 13. Round | 06/11/2021 | FK Renova | - | KF Shkëndija 79 | 0:1 |
Albania