| 1. Round | 06/08/2011 | Montpellier HSC | - | AJ Auxerre | 3:1 | ||||
| 3. Round | 20/08/2011 | Girondins Bordeaux | - | AJ Auxerre | 1:1 | ||||
| 12. Round | 29/10/2011 | Évian Thonon Gaillard | - | AJ Auxerre | 3:1 | ||||
| 15. Round | 27/11/2011 | AJ Auxerre | - | Olympique Lyonnais | 0:3 | ||||
| 17. Round | 11/12/2011 | AJ Auxerre | - | OGC Nice | 2:1 | ||||
| 18. Round | 17/12/2011 | Stade Brestois 29 | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 20. Round | 14/01/2012 | AC Ajaccio | - | AJ Auxerre | 2:1 | ||||
| 33. Round | 21/04/2012 | OGC Nice | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 34. Round | 29/04/2012 | AJ Auxerre | - | Stade Brestois 29 | 4:0 | ||||
| 35. Round | 03/05/2012 | Dijon FCO | - | AJ Auxerre | 0:2 |
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