| 3. Round | 18/08/2021 | FK Bregalnica Štip | - | KF Shkëndija 79 | 3:3 |  |
|||
| 4. Round | 22/08/2021 | KF Shkëndija 79 | - | Makedonija GP | 4:0 | ||||
| 5. Round | 28/08/2021 | FK Pelister | - | KF Shkëndija 79 | 2:2 | ||||
| 14. Round | 21/11/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Bregalnica Štip | 1:0 | ||||
| 15. Round | 28/11/2021 | Makedonija GP | - | KF Shkëndija 79 | 1:2 | ||||
| 16. Round | 05/12/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Pelister | 2:1 | ||||
| 17. Round | 08/12/2021 | KF Shkupi | - | KF Shkëndija 79 | 1:1 | ||||
| 18. Round | 12/12/2021 | KF Shkëndija 79 | - | FK Skopje | 1:0 | ||||
| 19. Round | 13/02/2022 | KF Shkëndija 79 | - | FC Struga | 3:1 | |
|||
| 21. Round | 27/02/2022 | KF Shkëndija 79 | - | FK AP Brera Strumica | 0:0 | |
|||
| 22. Round | 09/03/2022 | FK Rabotnički | - | KF Shkëndija 79 | 2:1 | ||||
| 23. Round | 13/03/2022 | KF Shkëndija 79 | - | GFK Tikvesh | 2:1 | |
|||
| 25. Round | 03/04/2022 | KF Shkëndija 79 | - | FK Borec | 0:0 | ||||
| 26. Round | 06/04/2022 | FK Pelister | - | KF Shkëndija 79 | 0:2 | ||||
| 31. Round | 04/05/2022 | FK AP Brera Strumica | - | KF Shkëndija 79 | 4:2 |
Croatia