| 5. Round | 21/08/2009 | NK Inter Zaprešić | - | HNK Šibenik | 0:1 | ||||
| 7. Round | 12/09/2009 | Lokomotiva Zagreb | - | HNK Šibenik | 0:0 |  |
|||
| 8. Round | 19/09/2009 | HNK Šibenik | - | NK Varteks | 2:1 | ||||
| 9. Round | 25/09/2009 | NK Zagreb | - | HNK Šibenik | 0:2 | ||||
| 10. Round | 03/10/2009 | HNK Šibenik | - | HNK Cibalia | 0:2 | ||||
| 18. Round | 27/02/2010 | HNK Šibenik | - | NK Zadar | 1:1 | ||||
| 23. Round | 03/04/2010 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 5:1 | ||||
| 24. Round | 10/04/2010 | HNK Šibenik | - | NK Zagreb | 3:1 | |
|||
| 26. Round | 17/04/2010 | HNK Šibenik | - | Hajduk Split | 0:1 | ||||
| 27. Round | 24/04/2010 | HNK Šibenik | - | NK Istra 1961 | 1:1 | ||||
| 28. Round | 01/05/2010 | NK Karlovac | - | HNK Šibenik | 0:2 | ||||
| 29. Round | 08/05/2010 | HNK Šibenik | - | Dinamo Zagreb | 2:1 | ||||
| 30. Round | 13/05/2010 | NK Međimurje | - | HNK Šibenik | 4:0 |
Bosnia-Herzegovina
Croatia