| 1. Round | 09/02/2025 | Comerciantes Unidos | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| 3. Round | 22/02/2025 | Comerciantes Unidos | - | Los Chankas | 1:1 |  |
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| 5. Round | 10/03/2025 | Cienciano | - | Comerciantes Unidos | 3:2 |  |
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| 6. Round | 27/03/2025 | Comerciantes Unidos | - | Atlético Grau | 2:2 | |
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| 8. Round | 13/04/2025 | Comerciantes Unidos | - | Sport Boys | 0:4 | ||||
| 9. Round | 20/04/2025 | Sport Huancayo | - | Comerciantes Unidos | 4:2 | |
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| 11. Round | 02/05/2025 | FBC Melgar | - | Comerciantes Unidos | 1:1 | |
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| 12. Round | 09/05/2025 | Comerciantes Unidos | - | Deportivo Binacional | 1:1 | ||||
| 13. Round | 17/05/2025 | Universidad Técnica | - | Comerciantes Unidos | 2:0 | ||||
| 14. Round | 24/05/2025 | Comerciantes Unidos | - | Cusco FC | 1:2 | ||||
| 15. Round | 12/06/2025 | Alianza Atlético | - | Comerciantes Unidos | 3:0 | ||||
| 10. Round | 19/06/2025 | Comerciantes Unidos | - | Alianza Lima | 0:1 | ||||
| 16. Round | 22/06/2025 | Comerciantes Unidos | - | Juan Pablo II College | 3:0 | |
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