| 1. Round | 02/07/2016 | Águilas Doradas | - | Deportes Tolima | 0:0 | ||||
| 2. Round | 11/07/2016 | Deportes Tolima | - | Deportivo Cali | 1:0 | ||||
| 3. Round | 14/07/2016 | Deportes Tolima | - | Fortaleza FC | 0:0 |  |
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| 4. Round | 17/07/2016 | Atlético Nacional | - | Deportes Tolima | 2:2 |  |
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| 5. Round | 24/07/2016 | Deportes Tolima | - | Once Caldas | 3:0 | ||||
| 6. Round | 31/07/2016 | Boyacá Chicó | - | Deportes Tolima | 0:4 | |
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| 7. Round | 08/08/2016 | Deportes Tolima | - | Millonarios | 3:1 | ||||
| 8. Round | 14/08/2016 | Atlético Bucaramanga | - | Deportes Tolima | 0:1 | ||||
| 10. Round | 28/08/2016 | Deportes Tolima | - | Atlético Huila | 1:1 | |
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| 11. Round | 10/09/2016 | Envigado FC | - | Deportes Tolima | 1:0 | ||||
| 12. Round | 14/09/2016 | Deportes Tolima | - | Cortuluá | 0:2 | ||||
| 13. Round | 19/09/2016 | La Equidad | - | Deportes Tolima | 2:2 | ||||
| 14. Round | 24/09/2016 | Atlético Huila | - | Deportes Tolima | 1:2 | ||||
| 15. Round | 09/10/2016 | Independiente Medellín | - | Deportes Tolima | 1:1 | |
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| 16. Round | 16/10/2016 | Deportes Tolima | - | Patriotas FC | 1:0 | ||||
| 20. Round | 20/11/2016 | Deportes Tolima | - | Jaguares de Córdoba | 2:0 |
Colombia