| 1. Round | 14/02/2010 | Alianza Atlético | - | Cienciano | 2:1 | ||||
| 2. Round | 21/02/2010 | Cienciano | - | Universidad San Martín | 1:3 | ||||
| 4. Round | 07/03/2010 | Cienciano | - | Sport Huancayo | 2:1 | ||||
| 6. Round | 21/03/2010 | Cienciano | - | FBC Melgar | 1:1 | ||||
| 7. Round | 29/03/2010 | Universitario de Deportes | - | Cienciano | 2:0 | ||||
| 8. Round | 04/04/2010 | Cienciano | - | León de Huánuco | 2:1 |  |
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| 9. Round | 10/04/2010 | José Gálvez | - | Cienciano | 1:0 | |
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| 10. Round | 17/04/2010 | Cienciano | - | Juan Aurich | 0:0 | ||||
| 11. Round | 24/04/2010 | Inti Gas | - | Cienciano | 3:1 | |
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| 12. Round | 02/05/2010 | CN Iquitos | - | Cienciano | 1:0 | |
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| 21. Round | 29/06/2010 | FBC Melgar | - | Cienciano | 3:0 | ||||
| 22. Round | 04/07/2010 | Cienciano | - | Universitario de Deportes | 1:1 | ||||
| 23. Round | 10/07/2010 | León de Huánuco | - | Cienciano | 1:0 | |
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| 27. Round | 08/08/2010 | Cienciano | - | CN Iquitos | 4:0 | |
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