| 2. Round | 26/08/1999 | Vitória Guimarães | - | SC Farense | 3:0 | ||||
| 12. Round | 28/11/1999 | SC Farense | - | Boavista | 0:2 | ||||
| 16. Round | 07/01/2000 | SC Farense | - | Campomaiorense | 2:2 | ||||
| 17. Round | 15/01/2000 | Os Belenenses | - | SC Farense | 1:1 |  |
|||
| 18. Round | 22/01/2000 | União Leiria | - | SC Farense | 2:0 | ||||
| 19. Round | 28/01/2000 | SC Farense | - | Vitória Guimarães | 2:1 |
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