| 16. Round | 18/12/1999 | FC Barcelona | - | Atlético Madrid | 2:1 | ||||
| 17. Round | 21/12/1999 | Atlético Madrid | - | Real Oviedo | 5:0 | ||||
| 18. Round | 04/01/2000 | Sevilla FC | - | Atlético Madrid | 2:1 | ||||
| 19. Round | 08/01/2000 | Atlético Madrid | - | RCD Mallorca | 1:0 |  |
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| 20. Round | 14/01/2000 | Rayo Vallecano | - | Atlético Madrid | 1:1 | ||||
| 21. Round | 22/01/2000 | Atlético Madrid | - | Real Sociedad | 1:1 | |
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| 22. Round | 28/01/2000 | RC Celta | - | Atlético Madrid | 0:1 | ||||
| 26. Round | 26/02/2000 | CD Alavés | - | Atlético Madrid | 2:0 | ||||
| 31. Round | 01/04/2000 | Atlético Madrid | - | Athletic Club | 1:2 | ||||
| 32. Round | 07/04/2000 | Deportivo La Coruña | - | Atlético Madrid | 4:1 | ||||
| 38. Round | 18/05/2000 | RCD Mallorca | - | Atlético Madrid | 1:2 |
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