| 2. Round | 25/01/2004 | Deportivo Guadalajara | - | Atlante | 1:0 |  |
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| 3. Round | 01/02/2004 | Atlante | - | Club Necaxa | 3:1 | |
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| 4. Round | 08/02/2004 | Puebla FC | - | Atlante | 1:1 |  |
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| 5. Round | 15/02/2004 | Atlante | - | Pumas UNAM | 2:4 | ||||
| 8. Round | 29/02/2004 | UAG Tecos | - | Atlante | 3:0 | ||||
| 11. Round | 21/03/2004 | Atlante | - | Atlas Guadalajara | 3:4 | ||||
| 12. Round | 28/03/2004 | Real San Luis | - | Atlante | 0:0 | |
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| 14. Round | 11/04/2004 | Club Irapuato | - | Atlante | 0:0 |
Mexico