| 3. Round | 17/09/2016 | Lanús | - | Unión de Santa Fe | 0:1 | ||||
| 4. Round | 25/09/2016 | Unión de Santa Fe | - | Belgrano de Córdoba | 0:2 |  |
|||
| 5. Round | 01/10/2016 | Godoy Cruz | - | Unión de Santa Fe | 2:1 | ||||
| 6. Round | 18/10/2016 | Unión de Santa Fe | - | Quilmes | 1:1 | ||||
| 7. Round | 23/10/2016 | Tigre | - | Unión de Santa Fe | 3:1 | ||||
| 8. Round | 01/11/2016 | Unión de Santa Fe | - | Sarmiento de Junín | 1:0 | ||||
| 9. Round | 09/11/2016 | Atlético Tucumán | - | Unión de Santa Fe | 1:1 | ||||
| 10. Round | 19/11/2016 | Unión de Santa Fe | - | Temperley | 2:1 | ||||
| 11. Round | 28/11/2016 | Gimnasia de La Plata | - | Unión de Santa Fe | 1:1 | ||||
| 12. Round | 04/12/2016 | Unión de Santa Fe | - | Rosario Central | 2:0 | ||||
| 15. Round | 12/03/2017 | River Plate | - | Unión de Santa Fe | 0:0 | ||||
| 16. Round | 18/03/2017 | Unión de Santa Fe | - | Colón de Santa Fe | 0:2 | |
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| 22. Round | 30/04/2017 | Unión de Santa Fe | - | Patronato de Paraná | 0:0 |
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