| 10. Round | 28/08/2016 | Fakel Voronezh | - | Mordovia Saransk | 1:2 | ||||
| 11. Round | 03/09/2016 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Fakel Voronezh | 0:0 | ||||
| 12. Round | 10/09/2016 | FK Neftekhimik | - | Fakel Voronezh | 1:2 | ||||
| 13. Round | 17/09/2016 | Fakel Voronezh | - | Sokol Saratov | 1:2 | ||||
| 14. Round | 26/09/2016 | Shinnik Yaroslavl | - | Fakel Voronezh | 0:2 | ||||
| 15. Round | 02/10/2016 | Fakel Voronezh | - | FK Tyumen | 0:0 | ||||
| 16. Round | 08/10/2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | Fakel Voronezh | 2:0 | ||||
| 17. Round | 15/10/2016 | Fakel Voronezh | - | Dinamo Moskva | 2:1 | ||||
| 18. Round | 22/10/2016 | Baltika Kaliningrad | - | Fakel Voronezh | 0:0 | ||||
| 19. Round | 30/10/2016 | Fakel Voronezh | - | Zenit St. Petersburg 2 | 1:0 | ||||
| 20. Round | 05/11/2016 | Spartak Nalchik | - | Fakel Voronezh | 1:2 | ||||
| 21. Round | 09/11/2016 | Fakel Voronezh | - | Luch-Energiya Vladivostok | 0:1 | ||||
| 22. Round | 13/11/2016 | Spartak Moskva 2 | - | Fakel Voronezh | 1:0 | ||||
| 23. Round | 19/11/2016 | Fakel Voronezh | - | FK Tosno | 0:0 | ||||
| 24. Round | 25/11/2016 | FK Tambov | - | Fakel Voronezh | 4:0 |
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