| 17. Round | 29/01/1999 | Veria FC | - | Ethnikos Piraeus | 4:3 | ||||
| 18. Round | 06/02/1999 | Iraklis Saloniki | - | Veria FC | 2:0 |  |
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| 21. Round | 28/02/1999 | Veria FC | - | AEK Athen | 0:3 | ||||
| 22. Round | 05/03/1999 | Apollon Smyrnis | - | Veria FC | 2:0 | ||||
| 23. Round | 13/03/1999 | Veria FC | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 0:1 |
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