| 3. Round | 21/07/2016 | Club Olimpia | - | General Caballero ZC | 0:0 | ||||
| 4. Round | 24/07/2016 | River Plate | - | Club Olimpia | 0:2 | ||||
| 5. Round | 30/07/2016 | Club Olimpia | - | Deportivo Capiatá | 4:0 | ||||
| 6. Round | 06/08/2016 | Cerro Porteño | - | Club Olimpia | 1:1 | ||||
| 9. Round | 28/08/2016 | Club Olimpia | - | Libertad | 1:1 | ||||
| 10. Round | 11/09/2016 | General Díaz | - | Club Olimpia | 1:2 | ||||
| 11. Round | 18/09/2016 | Club Olimpia | - | Guaraní | 0:1 | ||||
| 12. Round | 25/09/2016 | Club Olimpia | - | Sportivo Luqueño | 4:1 |  |
|||
| 13. Round | 02/10/2016 | Club Olimpia | - | Club Rubio Ñu | 3:1 | ||||
| 14. Round | 16/10/2016 | General Caballero ZC | - | Club Olimpia | 2:3 | ||||
| 15. Round | 23/10/2016 | Club Olimpia | - | River Plate | 5:3 | ||||
| 16. Round | 29/10/2016 | Deportivo Capiatá | - | Club Olimpia | 1:0 | ||||
| 17. Round | 06/11/2016 | Club Olimpia | - | Cerro Porteño | 4:2 |
Uruguay